Después de diez años dedicado a pilotar autos de carrera, en 1929, Enzo vio cumplido su sueño al fundar la sociedad deportiva Scuderia Ferrari, una filial de Alfa Romeo que se dedicaba al diseño, construcción y modificación de autos de esta marca para competir.

Para 1933, los Alfa Romeo empezaron a competir bajo la insignia de la escudería Ferrari, que en los primeros años de la década de los treinta ya a traía la atención de grandes pilotos y fanáticos del deporte de motor.

Pero las circunstancias frenaron el crecimiento del joven equipo de carreras. Bajo el auspicio del gobierno nazi, los autos alemanes cobraron protagonismo y en 1937, Enzo se vio obligado a vender el 80% de su empresa a Alfa Romeo.

Durante el primer año las cosas empezaron a marchar mejor, hasta que en los planes de Alfa Romeo dejó de figurar el emblema del caballito rampante para que los autos de Enzo empezaran a competir bajo el nombre del nuevo ente deportivo de la marca de autos: Alfa Corse.

Inicialmente, Enzo y sus mecánicos se sometieron a esta nueva estrategia de Alfa Romeo, pero el sueño de Ferrari no era hacer carros que lucieran un emblema distinto al de su escudería, así que se independizó nuevamente.

Así nacía Auto Avio Costruzioni, el nuevo proyecto de Enzo no llevaba su apellido porque una cláusula de su contrato con Alfa Romeo le impedía usarlo para la fabricación de carros durante cuatro años.

Junto con Alberto Maximino y Luigi Bellentani, Enzo construyó el 815, modelo con el que Auto Avio Costruzioni ganó en su categoría la Mille Miglia de 1940.

Cuando los sueños de Enzo marchaban nuevamente por buen camino las circunstancias volvieron a colocar obstáculos: estallaba la Segunda Guerra Mundial y un dictamen del gobierno italiano lo obligó a construir material bélico. Otra orden gubernamental lo hizo mudarse 16 kilómetros al sur de Módena, a la pequeña población de Maranello.

Cuando terminó la Guerra, Enzo ya podía empezar a fabricar automóviles con el emblema de Ferrari, así que puso manos a la obra y creó el modelo 125. En las pistas, el éxito empezó a sonreírle a Ferrari pero debido a que los autos aún eran de fabricación manual, los ingresos por ventas no eran los mejores.

Económicamente las cosas mejoraron para la casa de Maranello con el Ferrari 250, modelo con el que se sumaba a la era de la fabricación en serie, aunque siempre construyendo pequeñas cantidades de vehículos de gran calidad como Enzo deseaba que fuera, según lo expresó él mismo cuando Ferrari alcanzó la cifra de cuatro mil autos anuales: "Nunca he sido un constructor importante ni aspiré a serlo; sigo siendo un artesano de provincia".

La década de los 50 fue muy productiva para Ferrari, en el plano comercial y en el deportivo. Pero en los 60, los autos ingleses dominaron el panorama automotor y ante la posibilidad de desaparecer, Enzo aprovechó un buen momento en sus relaciones con la FIAT y decidió vender el 50% de las acciones de la casa de Maranello a la fábrica de Giovanni Agnelli, negociando sumar al imperio de Agnelli un 40% más al momento de su muerte, dejando el diez restante a su hijo Piero Lardi.